毛利小五郎是否认出柯南是新一（毛利小五郎真不知道柯南是新一吗）

没有认出。

毛利小五郎本来是个糊涂侦探，却因为经常以睡姿推理案情，屡破奇案，因此在业界享有“沉睡的小五郎”的美誉。实际上，他只是被柯南麻醉，借用声音说出真相，完全不记得过程，但仍对自己的推理能力深信不疑，认为自己有“双重人格”。