1、学习学校不同
五年一贯制大专是在普通高等大专学校就读，3年中专2年大专都在同一所大专院校完成。
2、就读方式不同
3+2大专是分中专和大专两个阶段，前三年中专段、后两年大专段，部分学校是5年均在中专院校完成，也有的3+2大专前3年在中专学校就读、后2年在大专院校就读。
3、含义不同
3+2大专学生需在中专学习阶段参加“三二分段”中职接高职统一转段选拔考试,成绩合格者转入高等院校完成两年大专学习.发两年制大专文凭。
五年制大专由高职高专院校承担，由省级招生部门一次办理录取手续，在同一所高校就读。不发中专毕业证，修业期满成绩合格者，由学校颁发五年一贯制专科毕业证书。
主要区别有两个:
一、招生对象不同
五年制大专的招生对象是初中生，毕业证书会注明学制是五年，而三年制大专的招生对象则是高中毕业生和三校生，其中三校生是指中专、职高和技校的学生，毕业证书上也会注明是三年的学制。
二、教学计划不同
五年制大专有两种教学计划，一种是“3+2”模式，学生可以只读三年，三年后可以直接毕业拿中专文凭，也可以选择继续深造，参加统一的普通高考，被录取后继续学习两年，毕业拿的就是大专文凭；另一种是“五年一贯制”，就是五年连贯性教学，中间不需要参加任何考试；而三年制大专就只有“三年一贯制”教学。
