果园土壤管理方法有清耕法、覆盖法、生草法、免耕法等。
我国果园传统的耕作方法是清耕法，即果园终年保持土壤疏松无草的状态。
清耕法的主要优点是：由于土壤保持疏松通气，故能促进土壤中微生物的繁殖和有机质的分解，
短期内可显著增加土壤中有效养分的供给，促进果树生长。
一、深翻
1.深翻土壤的作用
深翻果园土壤，可以起到松土、增加活土层厚度、改善土壤通气、改善土壤透水性能、增加土壤蓄水、调整土温及促进微生物活动的作用，从而改善土壤的理化性能，有利果树根系生长。
对土层瘠薄，园地下层皆是沙石的果园，逐年由里向外，上下翻1次，将熟土翻到下面或将熟土与沙掺合;沙石多的果园，定要逐年扩穴，去石客土;泥中掺沙、沙中掺泥，都能改变土壤的理化性质，增加土壤的保肥保水能力。
2 、深翻的方法
有逐年放树窝子深翻、果树行间和株间深翻、结合施基肥全园深翻等方法。山地果园在梯田或树盘的内半部深翻。深翻的宽度60～80厘米，深50厘米，深翻地长度，以树冠的1/2～1/4为宜。
深翻，可以一次或分几次进行，顺树行对土壤渐渐深翻;或结合增施有机肥进行扩大果树植穴深翻。
二、 增加土壤的有机质含量
增施有机肥料、行间种草、园地覆草、落叶归根、种植绿肥等措施，提高土壤有机质含量，改善土壤结构，缓解或避免土壤盐渍化，提高土壤肥力。果园行间种草，表土层不裸露，土壤温度变幅较小，水分蒸发量则少，气候干旱轻微时，能起到调节地温和抗旱保墒作用。
增加土壤有机质含量，土壤腐殖质增多，园地土壤的理化性状得到改善，能够缓解或避免土壤盐渍化，提高土壤肥力，土壤蓄水保墒能力和土壤肥力都能增强。增施有机肥，一定要施腐熟的有机肥。
当今各地果园，园地土壤有机物质含量有多有少，大部分果园的土壤，有机肥料的补充不足或根本得不到补充，有机物质含量逐年下降;也有少部分设施栽培(大棚栽培、温室栽培)果树，施用有机肥料超出了适宜范围，导致土壤中植物病源菌增加，造成化学农药的使用量逐年增加。
三、 为表层根系创造适宜生长的土壤环境
栽植任何一种果树，果树都通过根系吸收土壤含有的养分和水分。果树的表层根系是根系的主要活动区域，它对形成花芽及提高果品质量起决定性作用。与果树成花坐果、果实发育密切相关的钾、锌、硼元素，也主要靠表层根系吸收。
因此，栽培果树必须重视养根，要养护和利用果树的表层根系，就要为表层根系生长创造适宜生长的土壤条件，对于不良的土壤，就必须进行改良。
4四、行间种草、覆盖树盘、种绿肥
在果树行间种草或用有机物(农作物秆叶，杂草等)覆盖果树株间地面，或覆盖树盘，或在树行间种绿肥，都能起到土壤改良作用。
五、 间作
在果树行间种豆类、花生、薯类、绿肥等作物及药材植物。既可充分利用土地，增加经济收入，还可抑制杂草生长，减少土壤水分蒸发，缩小地面温度变化幅度，改善果园的小气候。
间作的作物，要植株矮小，生育期短，与果树争水、争肥、争光的矛盾要较小。干旱地区土壤瘠薄的果园，可间作草木樨、田菁等绿肥作物。既能改良土壤的理化性状，且对果树生长影响不大，还能增加肥源。树行间不宜种植瓜菜或繁育果树苗木。
