1、用法不同
收款凭证：
收款凭证是用来记录现金和银行存款收款业务的会计凭证，它是由出纳人员根据审核无误的原始凭证收款后填制的。在借贷记账法下，在收款凭证左上方所填列的借方科目，应是“现金”或“银行存款”科目。
付款凭证：
付款凭证是根据现金和银行存款付出业务的原始凭证编制、专门用来填列付款业务会计分录的记账凭证。
转账凭证：
转账凭证是用以记录与货币资金收付无关的转账业务的凭证，它是由会计人员根据审核无误的转账原始凭证填制的。在会计中，转帐凭证用以编制不涉及“现金”和“银行存款”科目的会计分录。
2、填制方法不同
收款凭证：
凭证左上角“借方科目”处，按照业务内容选填“银行存款”或“库存现金”科目；凭证上方的“年、月、日”处，填写财会部门受理经济业务事项制证的日期；凭证右上角的“ 字第 号” 处，填写“银收”或“收”字和已填制凭证的顺序编号；“摘要”栏填写能反映经济业务性质和特征的简要说明。
付款凭证：
付款凭证的格式及填制方法与收款凭证基本相同，只是将凭证的“借方科目”与“贷方科目”栏目交换位置；填制时先填写“贷方科目”的“现金”或“银行存款”科目，再填写作为与付出现金或银行存款相对应的一级科目和二级科目。
转账凭证：
在借贷记账法下，将经济业务所涉及的会计科目全部填列在凭证内，借方科目在先，贷方科目在后，将各会计科目所记应借应贷的金额填列在“借方金额”或“贷方金额”栏内。借、贷方金额合计数应该相等。制单人应在填制凭证后签名盖章，并在凭证的右侧或左侧填写所附原始凭证的张数。
3、侧重点不同
收款凭证是指用来反映货币资金增加业务而编制的凭证。
转账凭证是用来记录除现金、银行存款以外的其他经济业务的记账凭证。
付款凭证根据有关库存现金和银行存款支付业务的原始凭证填制，是登记库存现金日记账、银行存款日记账以及有关明细分类账和总分类账等账簿的依据，也是出纳人员支付款项的依据。
