葫芦丝清洗和消毒可以将葫芦丝内部封住吹孔，灌入浓盐水，浸泡几个小时后倒出，自然风干，让葫芦丝干透了。另外，浓盐水也可以消毒。葫芦丝外面，用医用酒精擦一擦就可以了。
葫芦丝是一种簧片乐器，所以要保持干燥的环境，是不能直接用水来清洗的，所以葫芦丝的保养就显得尤其重要，葫芦丝的保养需要注意以下几点。
（1）正确使用，忌猛吹，猛吸:演奏葫芦丝，巴乌时，应根据演奏用气方法和要求，正确运用气息吹奏，禁止猛吹，猛吸。否则会影响乐器的音色，
（2）轻拿轻放，禁压，禁撞：当使用乐器时应作到轻拿，并按演奏相关要求正确使用。乐器使用完毕后，应用干净毛巾擦拭，用一个布袋装起来或悬挂一段时间在放入乐器盒备用。切忌拿，放和使用过程中挤压，碰撞对乐器，以免使乐器产生裂纹而发生漏气现象。对于巴乌，要防止异物碰到簧片，一旦簧片受到大的振动而掉离竹管，可用合适的粘合剂粘合在原来的位置上，仍可使用。对于葫芦丝，要注意葫芦和竹管连接处的安全，不可随意拨折，以防止其松脱。
（3）忌爆晒，勤维护：葫芦丝，巴乌选用天然材质制作，故忌将乐器置于阳光下暴晒，以免产生裂纹和加速老化。对可坼卸式葫芦丝，巴乌应经常对金属接头插口处进行清洁，上油润滑，以防结垢
（4）专人专用，卫生健康：葫芦丝，巴乌乐器的使用应专人专用，并注意个人口腔卫生，饭后使用乐器一定要漱口，切忌食后将口腔中残物带入吹口内，以免造成乐器簧片阻塞，不但损坏了乐器，也不利于卫生健康。另外，经常用医用酒精擦拭乐器吹嘴，按孔等部位，以利杀菌和清洁乐器。
（5）发音异常，找专业修理：在使用过程中，如出现发音沙哑，嘶音，杂音或正确用气则吹奏不出声音，漏气，音调不准等情况。在自己不懂修理的情况下应该将乐器送到你选购乐器的琴行或者乐器制作厂家，请专业的乐器制作师帮你进行修理，切忌自己坼卸，修理。
