电子显微镜缺点:
(1)电子显微镜的电子对生物样品损伤极大,染料的保护则破坏了样品本身的形态。
(2)电子显微镜的样品缺乏有效的 tag(如光镜中的 GFP)
(3)电镜没办法看活动的样品。
(4)电镜是黑白的。
光学显微镜优点:
其分辨率受衍射极限的限制,故其分辨率不可能小于入射光波长的一半。但是由于其可以进行实时、动态观察,在生物学中的地位是无可比拟的,所以没有那个搞生物的离得开荧光显微镜、共聚焦之类的光镜。
电镜:由于用电子束来扫描成像,其分辨率可以很轻松的达到纳米级,这对于高分辨率成像的应用时不可取代的。但是由于样品制备复杂,需要真空条件,所以无法对活胞实现实时、动态观测,因而又大大限制了其应用。