动物的胚胎发育一般包括以下三个胚层：外胚层、中胚层和内胚层。中胚层是胚胎发育过程中的一个重要阶段，它发生的主要过程有：
1. 原肠发育：原始胚胎内部形成一个空腔，称为原肠或原肠腔。原肠由原肠芽形成，最终发展为消化系统的一部分，如食道、胃、小肠和大肠。
2. 心脏和血管系统形成：原肠内的细胞分化形成心脏和血管系统。中胚层中的心脏形成区域开始收缩，并自发地形成心脏管，最终发展为完整的心脏。
3. 骨骼、肌肉和泌尿系统形成：中胚层中包含的细胞类型分化为骨骼、肌肉和泌尿系统的前体细胞。这些细胞通过迁移和分化形成骨骼、肌肉和泌尿系统的各个组织。
总体而言，中胚层发生在动物胚胎发育过程中起到了至关重要的作用，参与了多个器官系统的形成和分化。
原肠作用之后胚胎有了内外两个胚层。胚胎继续发育，有的在内外胚层之间，有外胚层和内胚层（主要是外胚层）的细胞浸入，形成了间质（如腔肠动物），由于其作用不大，一般不将它作为一个胚层。在扁形动物以后，在内外胚层之间又有一个新胚层的产生，称为中胚层（mesoderm）。中胚层形成的方式主要有2种。
1．体腔囊法：在原肠背部两侧，内胚层向外突出，形成成对的囊状突起，称体腔囊。体腔囊与内胚层脱离后，在内外胚层之间逐步扩展成为中胚层，由中胚层包围的空腔称为体腔。因为体腔囊来源于原肠背部两侧，所以又称为肠体腔（enterocoel），这样形成体腔的方式称为肠体腔法（enterocoelous method或enterocoelic formation）。后口动物的棘皮动物、毛颚动物、须腕动物、半索动物、原索动物及脊索动物均以此种方式形成中胚层和体腔。
2．端细胞法：在胚孔的两侧，内、外胚层交界处各有一个细胞分裂成很多细胞，形成索状，伸入内、外胚层，是为中胚层细胞。在中胚层之间形成空腔即为体腔。由于这种体腔是在中胚层细胞之间裂开形成的，因此又称为裂体腔（schizocoel），这样形成体腔的方式又称为裂体腔法（schizocoelous method或schizocoelic formation）。原口动物以端细胞法形成中胚层和体腔。
动物体的组织、器官都是从内、中、外三胚层发育分化而来的。
1．外胚层：分化成上皮、皮肤腺、羽毛、毛等皮肤衍生物；中枢神经系统；主要感觉器官；消化道的前后两端。
2．中胚层：分化成肌肉、结缔组织、骨髓、多数动物的生殖系统、排泄器官的大部分。
3．内胚层：分化成消化道的大部（上皮）、消化道衍生物（肝、胰）和呼吸器官、排泄与生殖器官的小部分等。
