1.投资范围不同。科创主题基金的投资范围更广，只要是市场中和科技创新主题或概念相关的股票都可能成为这类基金的投资标的，不局限于科创板;科创50ETF是一只指数基金，即跟踪科创50指数。
2.交易场所不同。科创主题基金一般为场外基金，申购途径是银行、券商、第三方平台等;科创50ETF一般为场内基金，需要开通股票账户在二级市场公开买卖，和股票交易方式一样。
3.交易费用不同。科创主题基金收取申购费，一般1.2%-1.5%，赎回的时候还会收取赎回费，持有越久赎回费越低，此外还有管理费托管费等，这些费用会在每天的净值里扣除，不会感受到这些费用的支出;场内交易的科创50ETF收取的买卖佣金，这就看每个券商收取费用的差异了。
4.投资风格不同。科创主题基金一般为主动投资，追求的是超过基准的超额收益;科创50ETF是被动投资，追求和科创50指数之间的跟踪误差。
科创etf 指的投资于科创板的可在证券市场可以看到实时走势可以像股票一样随时交易的基金。
科创50指的是投资于科创板前50家最具规模最有代表性的50家上市公司。不能实时交易只能在15点之前申购或认购，只能在当天休市之后按基金公司公布净值申购。
两个共同点是交易费用低。
