分校和校区的区别主要在于管理结构和职能上的不同。
分校一般指学校正式设置的分校，它是一所完整的学校，有自己的学校名称、学籍等，拥有自己的师资力量和管理组成。拥有招收学生、培养教学、考试高考等全部职能，受到教育部门的备案和监督管理指导。
校区一般指的是学校的延伸校区，一般指分布在多个市区内的不同学校，它通常是一所大学校的分支校，有自己的管理框架以及负责学校教学工作的人员队伍，但没有自己的校名称和学籍，需要受到正式设立的学校的领导与管理，它的学校职能仅限于招收学生以及授课教学等。
分校和校区的区别为：
1、是否独立办学。
一般情况下，绝大部分的“分校”都与“本部”在教务管理方面相对独立，教学资源会共享。而“分校区”则大多数与“本部”除了地理区位不同外，其余方面皆保持一致，并且在各方面都直接受“本部”的管理与领导。“分校”与“分校区”，前者更强调组织机构关系的“分立”，后者则相反，“分校区”强调的是统一。
2、是否独立招生。
“分校区”一般没有独立招生的权力，其生源还是来自本部统招，再根据实际情况需要，按专业或者年级分配到不同的校区进行教学，所以分校区的生源质量有极好的保证；而大多数分校性质都属于民办独立院校，其招生工作基本独立于校本部，因此录取分数线也会低于校本部。
3、学位证上的区别。
最开始的“分校”和“分校区”，除了毕业证，本科学位证必须由校本部统一颁发，证书的封皮样式和文字与校本部毫无差别，证书内芯同样加盖本部公章和本部校长印，除了部分文字上关于毕业学校的表述会有区别。自2011年，独立分校开始陆续颁发自己的学位证书。
