二者区别很明显：
一、主任教师一般情况下是中层干部，科级学校只有办公室主任、教务处主任、政教处主任和团委书记在组织部备案，严格意义上不属于行政干部；校长，都是组织部任命的管理干部，是名副其实的行政管理人员。
二、主任教师主业是业务，精力放在业务上，一般都是业务尖兵排头兵，是学校的中流砥柱；行政角色也不过是带头执行学校决定，上传下达的作用，只有执行权没有决定权；从中层干部的发展趋势来看，有可能进步成长，提拔重用，成为副校长人选。校长则是全面管理，对学校的发展和运行进行谋划与决策，对教师和中层干部有培养责任。
三、一岗双责的追责力度不同。中层干部只是“传达执行”，所有造成的后果是无法预见性的，一般情况下不存在故意至错，最多就是承担失误性责任；严重的情况就是替罪羊。而校长则不然，应该对大多数的事故有预判性，应该承担后果责任。
四、在育人功能上，主任教师“具体而微”；校长则是“远大而宏”。
挂一漏万，请多批评。
学校是没有主任教师这一说法的，只有医院里有主任医生。学校教师的职称是二级、一级和高级。当然在学校管理岗位上有主任和副主任，这些主任分别管理着不同的部门，现在学校基本设立的部门有教务处、德育处、教科室、总务处等，这些处室都是在校长领导下开展工作。
