从节能角度：冷了再放入冰箱比较好，最起码能省点电费！ 太热的东西直接放在冰箱容易坏，等到比室温偏低再放就可以了。酸奶一般只需放在冷藏室就好了，一般冷藏室的温度在4℃左右，这个温度就可以保证乳酸菌不会变坏，保证酸奶的营养价值。
而放在冷冻室的话，温度过低会使乳酸菌的分子结构发生改变，导致营养价值发生变化。而且冷冻后食用温度过低对胃不好。自制酸奶最好及时放在冰箱中冷藏，如果一次吃不完，每次用干净勺子舀出来一部分，余下的仍然放在冰箱中。建议保存时间不超过3天。其实，酸奶发酵过程中，凝固是有过程的。
刚凝固的酸奶质地最为细腻，如果在凝固之后继续发酵，就会发现酸奶的表面出水或者有小的凹陷，质地也不那么细腻了，酸味过浓，活菌总数也在逐渐下降。所以，做酸奶的时候要注意多打开观察几次，只要凝固了就要及时取出来放入冰箱冷藏。冷藏一夜会让酸奶的香味变浓。其实只要使用科学的方法自制酸奶，冷藏保存1周以上是不成问题的，决不会坏掉的，食用后也不会对人体有伤害。
可是酸奶中的益生菌会随着贮存时间的延长而逐渐减少，健康功能自然大打折扣，我们自制酸奶就是要新鲜，新鲜的酸奶益生菌最多活性最强，保健功能也最好！所以我们说自制酸奶最好在2日内食用完毕，如果吃得少，那下次就少做一点了自己做的酸奶的好处：自制酸奶不但经济，而且绿色健康，不含人添加剂口感香醇。
刚做完的新鲜酸奶，每克含有15亿以上的活菌。
市售酸奶因为储存和运输的关系。使得产品变酸，活菌大量减少，市售酸奶也会为了凝结效果而添加果胶类的成分，并且偏重香味与口感的考量而添加约8%~10%的糖分，消费者食用过多反而容易发胖，糖尿病患者也不能食用。
