对于市面上常见的新风机，主要是采用HEPA过滤和消毒技术，部分兼用椰壳活性炭滤网过滤异味等。其过滤材质和口罩类似，通过物理阻隔，吸附等特性，过滤掉空气中的PM2.5、灰尘等微粒，大部分都是一次性耗材。新风机主要采用的是外循环净化，与空气净化器的内循环不同，新风机主要是将室外富氧空气在电机（驱动力）的作用下引入室内，并在HEPA过滤器的作用下将夹杂在空气中的粉尘、汽车尾气等污染物吸附在HEPA过滤器上。因此在新风机工作一段时间后，HEPA过滤器上会集满很多灰尘或病菌等，因此，需要定期、及时清理或更换新风机的HEPA过滤器。
当然，并非所有的新风机都需要HEPA过滤器，如单向流新风机，其工作原理是将室内空气抽出室外，形成负压，室外的空气通过门窗缝等地方进入，因此单向流新风机是没有HEPA过滤器的，更不用更换。相反，单向流新风机将室外空气引入室内时，形成正压，室内空气通过门窗缝的那个地方排出，此类新风机也是有过滤系统的。而双向流新风机则是对单向流新风机的完善与补充，双向流新风机既有排风系统，也有送风系统，双向流新风机通常在送风系统安装有HEPA过滤器。在电机（驱动力）的作用下将室外富氧空气吸入室内，同时经过过滤系统处理后形成比较干净、清洁的空气，同时也将室内富含二氧化碳以及其他室内污染物排出室内。
此外，值得一提的是，双向流新风机不仅能同时完成进出风的循环，还可以增加全热交换系统。全热交换的工作原理是在新风机工作时，室外进风与室内排风分解为正交叉方式流经全热交换芯体时，由于两股气流间存在温差，当两股气流流经热交换器时会发生热交换。例如，当室内温度为25摄氏度、室外温度为33摄氏度时，当室内外空气流经全热交换器时，输入的空气的温度会低于33摄氏度，同样输出的空气的温度也会高于25摄氏度，反之亦然。
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