1、遗传原因。
富士苹果裂纹，并非病菌引起，而是一种生理性的病害。富士源于日本，其亲本是国光和元帅，而国光是较易产生裂纹的品种，元帅也较易产生果锈，亲本裂纹性状遗传到富士上。
2、环境原因。
主要原因是土壤水分的不均衡(忽干忽湿)引起果皮和果肉细胞吸水膨胀的不同步，而造成裂纹。同时有研究表明，苹果生长发育期间干旱、高温、多风、多雾等果园环境突变是裂纹病发生的诱因之一。但有一点是公认的，那就是，夏季果实膨大期土壤持续干旱，特别是连续多日高温干旱后，突降暴雨，降雨强度大，持续时间短，雨过天晴，又接连遇持续高温会导致苹果裂纹病的大发生。这是因为，果实膨大期是果树需肥需水的关键时期，遇干旱高温天气，又未及时灌溉补水，会严重影响果皮细胞发育，导致与果肉组织发育不同步。突遇强降雨或大水漫灌，都易引起果肉细胞吸水膨胀，其膨胀强度较果皮细胞要大的多，致果皮皮层组织撕裂，形成果面裂纹。裂纹多发生在果实迅速膨大期或近成熟期。
3、土壤原因。
果园的土壤营养条件和苹果裂纹病的发生密切相关。土壤有机质含量高、养分均衡的果园，发生裂纹现象较少。有研究表明，土壤中钙、镁、硼、锌、氮、钾等元素的含量及其变化与裂纹发生有一定的相关性，特别是钙可以增强果皮细胞的韧性，充足的钙营养可减轻裂纹的发生。当土壤中钙、硼含量不足，或氮含量过高时，苹果裂纹病加剧，土壤补施硼肥和钙肥、增施钾肥均有助于缓解裂纹病的发生。长期生草的果园，土壤养分、水分供应平衡，裂纹病发生比清耕果园轻的多。
4、栽培管理原因。
果园管理粗放，树冠郁闭、内膛通风透光不良，导致果皮角质层发育不健全，弹性降低，裂纹病发生重。果实阳面通常着色均匀，极少发生裂纹，而果实阴面极易裂纹，尤其是两果邻近的阴面区域，往往成为裂纹的集中发生区。套袋果脱袋后遇雨或遭遇极度干热天气也易裂纹。
5、其它原因。
发病程度与树龄、树势有一定的关系。一般来讲，树龄大，树势弱者多而重，树龄小，树势强者少而轻。同时裂纹病与育果袋的质量有关，劣质袋加重病情发生。
