流经通州的河流如下：
1、潮白河
潮白河是北京地区的第二条大河，其上游分为潮河、白河两支流。两河在密云县的河槽村附近汇合以后，始称潮白河。
2、小中河
小中河位于顺义县城西。纵贯县境南北，发源于怀柔县的孙家史山和顺义县的李家史山交界地区，全长 39公里。
3、温榆河
温榆河位发源于北京市昌平县军都山麓。全长47．5公里。温榆河古称温水、湿余水、温余水，俗称果渠。属海河水系，为北运河在通州区以上的部分之名称。
4、通惠河
通惠河由郭守敬主持修建，自1292年开工，至1293年完工，元世祖将此河命名为“通惠河”。
5、玉带河
玉带河北起通惠河，绕通州城而过，是通州城的护城河。
6、北运河
北运河流经北京北部和东部地区。其上游为温榆河，源于军都山南麓，自西北而东南，至通州与通惠河相汇合后始称北运河。
7、萧太后河
始建于辽代，是北京最早开凿的人工运河。主要发源于东南护城河，一个支流源于朝阳区老虎洞。从西北流向东南。原来在通州境内汇入凉水河。
8、凉水河
现在凉水河水系干流发源于石景山区，源头是首钢污水处理场的出水口，全长约68公里。
9、新凤河
新凤河属凉水河支流，在烧饼庄汇入凉水河。全长27公里。
10、凤港减河
人工开挖的排水河道。由丁庄经西黄垡向东流入河北省注入北运河。
11、港沟河
位于通州，发源于凉水河右堤许各庄排污闸，溜入凤港减河，全长16.5公里。时间紧迫没有去成，有待开发。
12、通惠北干渠
通惠北干渠由高碑店湖引水，通过凉水河向大兴三海子地区蓄洪。
13、运潮减河
运潮减河属潮白河水系，位于通州区东北部，西起北关，东至潞城镇东堡村，北入潮白河。
潮白河为流经北京市北部、东部的重要河流，属海河水系。其上源有两支，东支为潮河，西支为白河。潮白河部分流经区域：
