菜籽粕由于含有β-硫代葡糖苷,在饲用量较高时会导致所饲各种家畜生长速度下降并产生食欲不良问题,特别是猪。
在蛋鸡饲粮中如配入量超过5%,在褐壳蛋鸡的蛋黄中就会有鱼腥味或品位下降,这是由于胆碱酯和芥子碱的存在促使蛋黄中三甲胺的积累。当配入量达10%时,蛋鸡会由于出血性脂肪肝导致死亡率上升。已有人提及用菜籽粕喂肉鸡导致胴体异味。也有报导述及肉鸡日粮中含菜籽粕30%时的腿部异常。用菜籽粕喂猪导致猪生产性能较差的主要原因是适口性不良。饲粮中菜籽粕含量高于5%时可导致仔猪和生产猪的甲状腺、肾脏和肝脏肿大。母猪饲粮中的菜籽粕用量应小于3%以防繁殖受损。用双低菜粕取代菜籽粕可使上述问题大为减少,但与芥子碱有关的问题除外。加拿大Canola委员会建议该粕在饲粮中的最大配入比例如下:雏禽/生长禽为20%,蛋禽/种禽为10%,仔猪8%,生长猪/种猪为12%,肥育猪为18%。