冷藏保存法：首先要将蒜苗充分预冷，预冷的主要目的是降低蒜苗的呼吸强度，以便于存储和运输。将蒜苗充分预冷后，放入冰箱存储，装入筐或板条箱内，或直接堆垛在贮藏的货架上，使库温控制在1℃左右。这样蒜苗就可以保存的时间比较久，而且还可以是蒜苗保持鲜度。
降氧法：降氧法又可以分为两种：快速降氧法和自然降氧法，前提都是密封保存。快速降氧法法指的是密封之后连续抽氧灌氮3到4次，自然降氧法指的是蒜苗密封之后，袋中的氧气由蒜苗自行吸收。在这里需要的是，保存环境的含氧量要控制在3%，二氧化碳在10%左右为好。
充二氧化碳法：使用这种方法时，蒜苗密封好之后，先吸出袋中的少量气体，然后充入二氧化碳，让氧气和二氧化碳含量基本相同即可。
堆垛法：将蒜苗放凉后装进条板箱里，或者直接堆在货架上，其温度最好设定在1℃左右。保存蒜苗新鲜最重要的就是温度。
真空保存法：将蒜苗放进密封袋中，抽部分空气之后密封保存。保存蒜苗的袋内氧含量宜在1-3%，二氧化碳含量在10%，温度应为14-16℃。
新鲜蒜苗最好的保存方法是保存在冰箱中。在保存蒜苗之前需要确保冰箱的内部是否干净，是否有异味较大的食物存放在冰箱中以避免蒜苗变味。
可以在冰箱的冷藏箱内放入容器盛放少许水以保持冰箱内部的湿度。
最好将蒜苗放在保鲜袋中或使用保鲜膜包裹后置于冰箱冷藏层可以最大程度增加其保存时间。
