灭菌是指用理化方法杀死一定物质中的微生物的微生物学基本技术。灭菌的彻底程度受灭菌时间与灭菌剂强度的制约，微生物对灭菌剂的抵抗力取决于原始存在的群体密度、菌种或环境赋予菌种的抵抗力。
灭菌是获得纯培养的必要条件，也是食品工业和医药领域中必需的技术。灭菌常用的方法有化学试剂灭菌、射线灭菌、干热灭菌、湿热灭菌和过滤除菌等
一、物理方法
干热灭菌法之干热空气灭菌法：
干热空气灭菌法是通过恒温干燥箱进行高温灭菌，由于热穿透力较差，细菌耐热性强，必须进行长时间段受高温作用才能达灭菌的目的。所以干热空气灭菌的采用的温度通常高于湿热灭菌法。为了确保灭菌效果，通常规定:135-140°C灭菌3-5h；160-170°C灭菌2-4h。180-200°C灭菌0.5-1h，杀死细菌和芽孢，从而达到灭菌目的的一种方法。
主要用于不便于在压力蒸气灭菌器中灭菌，且不易被高温损坏的玻璃器皿、金属器械以及不能和蒸汽接触的物品的灭菌
干热灭菌法之火焰烧灼：
火焰烧灼的原理是：将要灭菌的物品在火焰之中燃烧，使所有微生物碳化，方法简单灭菌彻底，对物品毁坏大。
适用于：无经济价值的物品的灭菌、不怕火烧的实验品器具，如接种杯、刀片、镊子、容器等物品的灭菌。
湿热灭菌法：
压力蒸气湿热灭菌是最常见的灭菌方式。它通过高压蒸气以及在蒸气环境中存在的潜热作用和良好的杀伤力，使菌体蛋白凝固变性，然后死亡。
这个方法适用于布类工作服、各种器皿、合金设备、橡胶塞、蒸馏水、棉塞、纸及某些培养液的灭菌。
紫外线灭菌：
用紫外线灯照射灭菌方式。紫外线是一种低热量的电磁辐射，可消灭多种细菌。紫外线的杀菌原理有两方面，一是直接作用，即破坏细菌、病毒的DNA等遗传物质，改变细胞的遗传转录特性，使生物体丧失蛋白质的合成和复制繁殖能力。二是间接作用，即一定波长的紫外线（通常采用UVA波段）照射纳米TiO2等光催化剂（光触媒），发生类似光合作用的光催化反应，产生出氧化能力极强的自由氢氧基和活性氧，具有很强的光氧化还原功能，可氧化分解各种有机化合物和部分无机物，能破坏细菌的细胞膜和固化病毒的蛋白质，可杀灭细菌和分解有机污染物，把有机污染物分解成无污染的水（H2O）和二氧化碳（CO2），因而具有极强的杀菌、除臭、防霉、防污自洁、净化空气功能。
局限于超净工作台、微生物安全柜及整个实验室的杀菌。
过滤除菌法:
利用细菌不能通过致密具孔滤材的原理以除去液体或气体中微生物的方式。常用作热不稳定的原料或药品溶液的除菌。
适用于遇热易发生分解、变性而失效的试剂、酶液、血清、培养液等
二、化学方法
化学消毒剂消毒法：
常用的化学消毒剂包括甲醛、高锰酸钾、70%-75%乙醇、过氧乙酸、过氧化氢、0.1%新洁尔灭、环氧乙烷、碘伏或碘酊等。
适用于那些不能利用物理方法进行灭菌的物品、空气、工作面、操作者皮肤、某些实验器皿等。
