源流一
源于 姬姓，出自周文王裔孙仲峬的 封地，属于以 封邑名称为氏。据 史籍《通志·氏族略·以邑为氏》记载，周文王的儿子 虞仲有孙名仲峬，他同召伯虎、申伯、南仲、尹吉甫等大臣一起，辅佐周宣王姬静南征北战，使周王朝统治的疆域不断扩大，号称“宣王中兴”。姬仲峬，亦称樊仲甫、樊仲，逝世后谥号“穆”，故又作樊穆仲，他是 鲁献公姬具的第二个儿子，在周王室为卿士，是辅佐周宣王中兴的贤名之臣，在当时的诸侯之间，地位十分崇高和尊贵。在樊仲峬的后裔子孙中，皆以先祖封邑名称为姓氏，世代称樊氏至今。因其始祖为樊仲峬，史称姬姓樊氏、樊氏正宗。
樊氏族人大多尊奉仲峬为得姓始祖。
源流二
源于 子姓，出自商汤王的后代，属于以国名为氏。据《左传》记载，商汤的后裔子孙，在商中期以后，按分封的地名，形成了陶、施、樊、繁、锜、几和终葵七大族，其中有樊氏，子孙一直沿袭下来。
商朝灭亡之后，周武王姬发把殷商的遗民七族划归齐国管辖，故而在春秋战国时期，樊氏家族多在齐、鲁一带。孔子的弟子樊须，字子迟，便是商人七族中樊氏的后人。史称子姓樊氏。
源流三
源于官位，出自西周时期官吏樊人，属于以官职称谓为氏。樊人，亦称樊缨、鞶人，是西周时期设置的一种官位，职责就是掌管周王朝君王行走的道路。在典籍《周礼·春官·巾车》中记载：“掌王之五路。一曰玉路，钖樊缨。樊，马大带也。”钖，就是马额头上的金属装饰物，走动时会发出悦耳声响；繁，就是束马的腹带；缨，就是挽马的颈革；都是用来辂马的带饰与工具。实际上，樊人就是在指定的王路上为君王驾御马车的小吏。
在樊人的后裔子孙中，有以先祖官职称谓为姓氏者，称樊人氏，后省文简化为樊氏。
源流四
源于 古巴人，出自汉朝时期巴国，属于汉化改姓为氏。上古时期， 古代巴人居住在今甘肃南部地区，后迁徙到武落钟离山(今湖北长阳)，以巴廪君为首领，由巴氏、巴蔓氏、巴瞫氏、巴相氏、巴郑氏这五个姓氏部落组成部落联盟，史称古巴国，国人称巴人。古巴国在夏王朝时期称“巴方”，在商王朝时期称“巴奠(甸)”。
巴国形成于公元前十一世纪，灭亡于战国中期，约有八百年历史。秦国灭巴国之后，故巴国五个姓氏部落中的巴蔓氏族部落，后取谐音汉字“樊”为姓氏，称樊氏，世代相传至今。 按历史、文物专家李学勤考据，信阳平桥樊君墓出土铭文，樊为芈姓。 为西南少数民族姓氏。东汉时，巴郡、南郡蛮夷本有五姓：巴氏、樊氏、莘氏、相氏、郑氏，包括混入赢姓、子姓、姬姓的部分樊姓 ，皆出于武落钟离山（今湖北 长阳 西北）。
源流五
源于 满族，属于汉化改姓为氏。据史籍《清朝通志·氏族略·满洲八旗姓》记载：满族伊拉哩氏，亦称伊里氏、伊拉礼氏、伊喇立氏，满语为Ilari Hala，汉义“开”，世居乌喇(今吉林永吉乌拉街至辉发河口、拉发河流域、双阳县境)、叶赫(今吉林梨树叶赫乡南部)、蜚优城(今吉林珲春三家子乡高丽城村)、伊罕阿林城(今吉林市东北十五公里处)、松花江流域等地区。后有锡伯族引为姓氏者。
清中叶以后，满族、锡伯族伊拉哩氏多冠汉姓为樊氏、伊氏、何氏、赵氏、尼氏、潘氏、苏氏、许氏、岳氏、禹氏、仉氏、柏氏、郝氏、靳氏、李氏等。
源流六
出自三国时期，河南省许昌县小召乡樊庄村。
