二者都是对于基因而言的,编码的部分为外显子,不编码的为内含子,内含子没有遗传效应.外显子就是在成熟mRNA中保留下的部分,也就是说成熟mRNA对应于基因中的部分.内含子是指在mRNA加工过程中被剪切掉的部分,在成熟mRNA中不存在的部分.DNA分为编码区和非编码区.编码区又分为外显子和内含子.一般由外显子控制遗传和蛋白质的合成.目前生物学界对内含子的作用还不大清楚,正在研究之中.基因非编码区的调控作用控制转录的时间,有启动子和终止子(启动子是RNA聚合酶识别和结合的部位,有了它才能驱动基因转录出mRNA,而终止子则是让转录在所需要的地方停止下来),还有控制那些基因要表达,那些不表达,笼统的说就是非编码区与基因的表达有关