目前国际上最权威的蛋白质序列数据库是（蛋白组学结果在线分析平台）

SWISS--PROT是由Geneva大学和欧洲生物信息学研究所(EBI)于1986年联合建立的，它是目前国际上权威的蛋白质序列敬据库。

SWISS--PROT中的蛋白质序列是经过注释的。SWISS--PROT中的数据来源于不同源地:(1)从核酸数据库经过翻译推导而来(2)从蛋白质数据库PR挑选出合适的数据;(3)从科学文献中摘录;(4)研究人员直接提交的蛋白质序列数据。2004年3月的SWSSPROT43.0版本有146720序列登录项，包含摘自113719篇参考文献的54093154个氨基酸。