国家自然保护区有11个，如下:
1、五花顶国家级自然保护区，位于位于辽宁省绥中县，2018年2月8日升级为国家级自然保护区。保护区属森林生态类型自然保护区，其主要保护对象为典型落叶阔叶林与天然成片山杏矮林等森林生态系统、珍稀濒危生物资源及其栖息地和水源涵养区。
2、园池湿地国家级自然保护区，位于吉林省安图县，2018年2月8日升级为国家级自然保护区。保护区是长白山腹地长白落叶松沼泽集中连片、面积较大、保存较为完整的森林沼泽湿地，森林覆盖率达81.2%。另外，保护区内无常驻人口，无农业用地，无工矿企业，距离居民点较远，人为干扰少，基本保持着自然状态，区内空气清新，河水清澈，没有环境污染，自然度较高。
3、仙洞山梅花鹿国家级自然保护区，位于黑龙江省拜泉县的国富林场境内，2018年2月8日升级为国家级自然保护区。保护区占地面积50.76平方公里，目前共有野生梅花鹿超过300多只。在原野上、树丛中，一只只梅花鹿迈着轻盈的脚步，时而疾驰、时而驻足、时而俯身觅食、时而回首眺望、时而四蹄劲舞、时而口中呦呦吟唱……在这里，人与自然的和谐、人与动物的和谐变成了现实。
4、朗乡国家级自然保护区，位于黑龙江省伊春市，距离位置在小兴安岭南麓，地处朗乡镇，2018年2月8日升级为国家级自然保护区。保护区森林覆盖率达到85%，而绿色植被覆盖率达到96%。生成每平方厘米20000个负氧离子，是城市的20倍，物产自然天成，得天独厚。高密度森林覆盖率，超多密集的负氧离子富有“大气维生素”美誉。
5、南莫且湿地国家级自然保护区，位于四川省西北部、阿坝藏族羌族自治州壤塘县东部，2018年2月8日升级为国家级自然保护区。保护区始建于2002年9月，以黑颈鹤、白唇鹿和湖泊、沼泽等高原湿地生态系统为主要保护对象。
6、红碱淖国家级自然保护区，位于陕西省神木市与内蒙古鄂尔多斯市交界处，地处毛乌素沙漠边缘地带，2018年2月8日升级为国家级自然保护区。保护区是沙区凹地汇聚地下水及地表水形成的湖泊，形成于上世纪二十年代，也是我国最大的沙漠淡水湖和最大的遗鸥繁殖栖息地。
7、太宽河国家级自然保护区，位于山西省运城市，2018年5月31日升级为国家级自然保护区。保护区有较丰富的珍稀濒危树种，种数占山西省珍稀濒危保护树种的70%以上；其中，4种为在该地长期引栽，27种为自然分布。
8、头道松花江上游国家级自然保护区，位于吉林省抚松县东南部，2018年5月31日升级为国家级自然保护区。保护区主要保护北温带针阔混交林、中华秋沙鸭等珍稀濒危野生动植物、野生笃斯越橘与藓类沼泽湿地。
9、甑峰岭国家级自然保护区，位于吉林省和龙市与安图县境内，2018年5月31日升级为国家级自然保护区。保护区以“千年红豆杉富氧长廊”闻名，主要保护国家一级珍稀濒危野生植物“东北红豆杉”。40余万株野生东北红豆杉生长在这里，形成一个巨大的红豆杉群落，其中树龄在千年以上的20多株，树龄最大的一株已经有2800年历史，胸径185厘米，堪称“树王”。
10、细鳞河国家级自然保护区，位于黑龙江省鹤岗市西北部，小兴安岭东南坡，2018年5月31日升级为国家级自然保护区。保护区地处小兴安岭东南坡，向三江平原过渡地带区内有大面积的原始柞树林，少量的原始红松林和大量的原始林间湿地，并有大面积的明水面等，河流、水流密布，是一片森林覆盖率很高、环境多样的区域。
11、大沙河国家级自然保护区，位于贵州省道真仡佬族苗族自治县北缘，2018年5月31日升级为国家级自然保护区。保护区是我国特有珍稀植物银杉现存分布数量较大的地方，占全国天然银杉总植株的26.4%，是全国最丰富的地区之一。银杉是世界上300万年以前的古稀孑遗植物，被誉为林海里的珍珠、当今的活化石、植物中的“熊猫”。
