第六集
太平知县吴淼水仅三天就破得一桩凶杀命案，凶犯曹墨供认因垂涎玉娘美色意欲夺爱而杀了其夫王四，并交出了杀人时所穿的血衣一件。一年后，宋提刑前往太平县视察狱事的路上，将一伙盗贼拿了个人赃俱获，给了鼓吹自己治县有方的吴知县一个难堪。在视察牢狱时，一位给待决死囚儿子喂食的白发老母令宋慈心动。宋慈突然问何故杀人，曹墨脱口而呼没有杀人！旋即又连连改口是他杀了王四。宋慈疑云在心；吴知县暗暗惊心。是夜，宋慈翻阅案卷，发现太平县疑案多多，愤然难抑。而吴知县却半夜悄悄来到死牢，对曹墨循循善诱，嘱其不得翻供，并许诺：只要坚持原先的供词，可免其一死。
第七集
宋提刑正让捕头王半夜去请吴知县问案，吴知县正好跨了进来，并呈上了曹墨一案的所有案卷，还尤其郑重地向宋提刑展示了那件作为物证的血衣。不想宋提刑细察血衣之后却愤然击案。宋慈对捕头王和英姑说，除非在三天之内查出真凶，否则将无法改变经刑部审核的原判，可案发一年，时过境迁，查找真凶谈何容易！县衙书吏唐某，怀疑玉娘与曹墨通奸杀夫而在暗中监视，果然发现了玉娘有不轨之举，就急急往宋大人下榻的官驿奔去。时间紧迫，没等天亮，宋慈就命吴知县陪他去一年前的案发现场。路上，吴知县向宋慈讲述当时的案发过程，宋慈听出了几处漏洞，却不动声色。到了江边，宋慈果然发现一大破绽：原案中所称的案发现场，其实决非是案发的第一现场！
第八集
正当宋慈找不到头绪之际，唐书吏却提供了一条线索：被害人王四之妻玉娘和凶手曹墨家过往甚密，且经唐书吏描绘的玉娘还是个淫荡之妇；宋慈又传王媒婆询问，而从王媒婆嘴里说出的玉娘，却又是一位恪守妇道的贤淑女子。同是一个玉娘，同是当初曹墨和玉娘在王婆瓜店的邂逅，从吴知县、唐书吏和王媒婆三人嘴里说出来却是截然不同，宋慈断定三人之中必定有人说谎。为求个眼见为实，宋慈带着英姑去找玉娘求证。刚到门前，正遇玉娘出门往城东而去，宋慈示意，和英姑暗中跟着。路过王婆瓜店时，宋慈又发现了本案的又一个破绽：曹墨绝不可能在案发日谋杀王四！
第九集
宋慈和英姑跟踪着玉娘，果然见玉娘进了曹府。宋慈进了曹家，见正堂大门紧闭，英姑上前推开门，只见堂上摆着两口棺木，一口是母亲为即将受刑的儿子预备的，另一口是老母亲自己的，宋慈见状动容。玉娘终于对宋慈细说了前因：吴知县曾认定这是一桩奸夫淫女通奸杀人案，公堂之上，严刑逼供，是夜，又将曹墨和玉娘同囚一处，曹墨为保玉娘清白无罪，独自顶下罪名。宋慈再向朱母问起那件血衣时，老人家当时就泪如泉涌……当晚，宋慈连夜将曹墨提出死牢问案，曹墨万念俱灰、拒不翻供。宋慈以曹母讲的一个故事，让曹墨一场痛哭……虽然能证明曹墨并非凶手，但找不出真凶，还是翻不了案，而三日刑期已去其半，宋慈焦心如焚。正在这时，捕头王无意中提到了来太平县路上查获的那帮盗贼，令宋慈双眼一亮！
第十集
吴知县对宋慈要提审那帮与本案毫无瓜葛的盗贼甚为不解，而宋慈则微笑着说所谓病急乱投医，碰碰运气而已。当晚，盗贼们被提上大堂。宋慈机智提问，果然获得重大线索：被害人王四的一个银袋子成了其中一个小蝥贼屁股上的补丁。待再提审那小贼，却说银袋子是他在逛窑子时从一个叫王四的嫖客身上偷的，而王四当日已经遇害，不可能出现在窑子里。刚找到的线索又断了。宋慈泡着脚，在心里推着案情，忽然双目一瞪。宋慈快马赶到当初来太平县路过的一条水中坝前——这是一条横卧水中的石坝，汗时作桥，汛时为坝，当初王四进山收取货银，这是必经之地。宋慈恍然大悟，一年前的所谓谋杀王四案昭然若揭，而此时离曹墨的行刑日期仅存几个时辰！
第十一集
大堂之上，宋慈胸有成竹，一一指出了原案的破绽；吴知县大汗淋漓，竭力狡辩，最终还以血衣为证。而宋慈却说本案最大的破绽也正是这件血衣。继而以无可辩驳的逻辑推理，道出了这件血衣的来历：原是一位慈母不忍心儿子再受酷刑而亲手制造的一件假证。宋慈条分缕析，层层推理，最后结论是王四溺水而死。吴知县拼死力争，说宋大人所言不过是推断，并无证据。宋慈下命开棺验尸：人被杀死后抛尸水中，鼻息全无而沙土进不得颅内；而生前落水溺死者，水中挣扎，鼻息取气，必然吸入沙土——取出死者骷髅，以热水自脑门穴灌入，随即流出，果见过滤用的白布上有一小撮河中细沙……此案真相大白：王四致死本无凶手，而曹墨蒙冤却是知县恶意所为，依大宋律，知县吴淼水就地罢官。未几，却因西湖边一个小小的插曲，宋慈突然请命离京，执意要到外省任职，此举之迷，直至十六年后宋慈重返京城才得以解开……
