领导说辛苦了回复职责所在合适吗

非常不合适。你说职责所在，意思就是这是应该做的，不怕辛苦。但是你强调的是职责，给人的印象是，你工作非常重要。在领导面前，表达自己的工作如此重要，暗示应该加薪。这当然不合适。领导说辛苦了，是一句场面话，你应该回复，您放心，工作顺利完成。