两个站是不同的,肇庆站,位于中国广东省肇庆市端州区西江北路,邮政编码526020,始建于1989年,隶属中国铁路广州局集团有限公司肇庆车务段(广东三茂铁路股份有限公司)管辖,现为二等站。
肇庆市火车站综合体建设项目是广东省、肇庆市重点项目,位于肇庆市端州区三茂铁路以南、肇庆大道以北,坐落于原肇庆火车站及口岸大楼、公交站原址之上。2016年10月28日动工建设。项目总规划用地面积66281平方米,端州站,是广佛肇城际铁路上的一个中间站点,位于广东省肇庆市端州区,隶属中国铁路广州局集团有限公司管辖。