早期拓甲骨文，都要用到白芨水。白芨是一种中药材，把它浸泡在温水里，会产生一种弱胶质。当天制好的白芨水用于拓印，对甲骨的侵蚀很小。但是时间一长，白芨水的胶质就会变厚，哪怕只隔了一天，都会粘在甲骨上面。而且虫子特别喜欢吃这种植物胶，最后会污染甲骨、蛀蚀甲骨，产生风化、开裂等现象。所以过去在传拓甲骨文的同时，多少会造成甲骨的损伤。
考虑到用白芨水墨拓会污染甲骨，研究人员提出用纯净的蒸馏水或特制的去离子三级水代替白芨水进行拓制的方法。这种水使拓纸与甲骨粘紧，对甲骨几乎没有损伤，而被甲骨所吸收的微量水分，可以慢慢自然蒸发。这是甲骨墨拓技艺一大创新，等于把传统的墨拓技术提高到了一个新的层面。
有的甲骨品相好，比较坚硬，用人头发刷敲没有问题。但是有的甲骨，比如表皮已经风化起翘的甲骨，难免与拓纸粘连不牢，只能轻轻地刷。人头发刷的力道不足，有的字口显不出来，如果仍旧用轻敲的方法，就会对甲骨造成损伤。研究人员尝试使用马鬃刷。马鬃，就是马脖子上的一绺长毛。马鬃刷不硬不软，恰到好处，一刷字口就出来了，而且也不伤甲骨，这又是技术上的精益求精。马鬃刷的使用，在“保护第一”的情况下把甲骨文整理工作又往前推进了一步。
