1. 种植的环境条件不同
阿拉比卡种咖啡树，适合种植在海拔600-2200米，温度在15°-24°C，年降雨量在1200-2200毫米的山地环境中。而罗布斯塔种咖啡树，对海拔的要求不高，0-800米之间都能种植，也适合温度更高的环境（18°-36°C），和2200-3000毫米/年的降雨量。就产量而言，阿拉比卡每公顷生产的咖啡比罗布斯塔少，这使得阿拉比卡的种植成本高得多。
咖啡豆形状不同
阿拉比卡咖啡豆比罗豆略大，属下大部分呈长条形（如铁皮卡种），豆子的中心线呈曲线；罗豆相对更椭圆，中心线比较直（这一点可以比较直观分辨两者）。咖啡豆之间也存在结构差异，这可能解释了为什么在相同的条件下，两种咖啡豆的烘焙方式不同。
3.咖啡因和绿原酸的含量不同
咖啡因和绿原酸(CGA)都有苦味，它俩被认为是昆虫和动物的抑制剂。罗布斯塔的咖啡因含量和绿原酸含量大约是阿拉比卡咖啡的两倍，它在野外生长得更“健壮”，在咖啡风味表现上也会更苦，更“粗糙”。（越南咖啡就是典型的罗豆做的咖啡，滴滤后必须加炼乳才能喝的下去，否则苦味太重，单独喝大多数人受不了；还有标题说到的，有些朋友说喝咖啡容易“心慌”，那有可能就是喝到含大量罗豆做的咖啡，咖啡因含量较高所导致，如一些连锁咖啡馆的意式咖啡，或是速溶咖啡，都是罗豆的“主站场”）
4. 脂糖含量不同
阿拉比卡所含的脂质几乎比罗布斯塔多60%，糖的浓度几乎是罗布斯塔的两倍。这些脂糖在咖啡烘焙过程中发挥着重要的作用，咖啡的迷人香气就是由这些转化而成，喝咖啡过程中的甜感也因此表现不同。
5.授粉方式不同
阿拉比卡是一种自花传粉植物，这意味着与罗布斯塔相比，阿拉比卡在整个生命周期中发生的突变和变异更少。（比如铁皮卡、波旁、卡杜拉等都属于阿拉比卡变异而成的）
6. 染色体数量不同
阿拉比卡有44对染色体，罗布斯塔只有22对染色体。
