1.区别主要是球茎顶部有叶芽，鳞茎为片状重叠，而块茎则为不定芽，三者形态略有相似，均为植物繁殖所用器官。
2.球茎很容易与其他一些地下变态茎混淆，如块茎、鳞茎，还容易与一些形态相似的变态根如肉质直根、块根等混淆。
3.鳞茎为地下变态茎的一种。变态茎非常短缩，呈盘状，其上着生肥厚多肉的鳞叶，内贮藏极为丰富的营养物质和水分。能适应干旱炎热的环境条件。
4.块茎是植物学名词术语。它是植物茎的一种变态，呈块状，故名。既然是茎，因此就具有植物茎的主要特征，比如芽、叶痕等。我们常吃的马铃薯是最典型的块茎。
球茎与鳞茎及块茎均有区别。番红花和唐菖蒲具典型球茎。为节间短缩的直生茎，常肉质膨大呈球状或扁球状，节明显，其上生有薄纸质的鳞叶，顶芽及附近的腋芽较为明显，球茎基部常生有不定根，如慈姑、荸荠等。
不少球茎和鳞茎在外观上相似，但鳞茎的叶已肉质化，解剖时可以区别。地下茎膨大呈球形，茎内部实质，表面有环状节痕，顶端有肥大的顶芽，侧芽不发达。如唐菖蒲、香雪兰等。
鳞茎包括较大且通常为鳞茎形的地下芽和伸出地面的短茎，膜质或肉质的叶互相重叠，从短茎上生出。洋葱即为熟知的鳞茎。鳞茎的肉质叶用以储存食物，可使植株於缺水时(如冬季或乾旱时)休眠，当条件有利时又恢复生机。
鳞茎也具顶芽和腋芽可从其上发育出地上的花茎，开花结实。从鳞茎盘的下部可生出不定根，每年可从腋芽中形成一个或数个新的鳞茎，称为子鳞茎，可供繁殖用。
