涡河历史上为重要水道，建安十四年（209年），曹操曾引水军经涡河入淮；宋绍兴三十一年（1161年），金南侵亦自涡河入淮。
从黄河在中牟、开封一带决口之后，黄泛水都经涡河入淮，使涡河排水系统受严重破坏。
尤其20世纪60年代以来，河南省农田采用虹吸管引黄河水灌溉，尾水中夹带大量泥沙不断淤积涡河河道，据河南省水利厅测算，河南省境内涡河淤积土方有3165万立方米；安徽省境内涡河根据1981年实测河道断面资料计算，共淤积土方达7500万立方米；致使大寺集以上河床淤高6米，大寺集至涡阳、蒙城段河床淤高2～5米。
涡阳站历史上最大流量为2480立方米每秒（1963．8．7）相应最高水位是30．45米。
1962年4月发生断流、最低水位是18．99米。
现下游两岸筑有防洪堤，但不能抗10年一遇以上的洪水。
涡河渠化工程始于60年代，1960年蒙城节制闸建成，闸上最低控制水位23．0米，正常水位27．1米，回水可抵涡阳，河道宽200米，水深8米，1971年蒙城建成100吨级船闸；1971年建成涡阳节制闸，闸上最低控制水位24．5米，正常水位28．0米，回水达亳州大寺集，河道宽200米，水深8米。
1976年建成涡阳100吨级船闸；1978年大寺集建成节制闸，回水可达河南省鹿邑县，闸上正常水位28．5米，河道宽200米，水深8米，但由于涡河的水量要优先考虑农业用水，因此渠化河段仍经常出现淤浅，仅蒙城至怀远河段，枯水期就有20处浅滩，只能通航5～10吨木船，运力不能充分发挥。
