牛顿作为自然科学家，作为近代著名的物理学家，他在晚年研究的并不是自然科学，相反，他在晚年研究的是唯心主义和神学，他陷入到了神学的实验当中。
首先，牛顿研究的是神学，因为牛顿作为近代的著名的物理学家，在他当时那种历史条件下，他所做研究和当时的历史条件和物质生活条件已经是格格不入了，所以说他将那种无法用实验证明的规律，就将其将其归结为神，也就是近代西欧所从所崇尚的神学。
第二点，牛顿作为自然学家和著名的物理学家，他是自然科学开创者，也是自然科学集大成者，但是牛顿并不是唯物主义者，相反它是唯心主义。在他晚年的时候，在他的眼里，世界是由心而产生的。所谓的规律也是从心出发的，所以说心才是他所描述的物质世界的根本，物质世界是由心产生的，所以在牛顿的看来，唯心主义是最值得人们去研究的。
还有一点，牛顿在他的晚年，他放弃了对自然科学的研究，他发现在当时的环境下，有很多东西已经无法用牛顿定律去解释，所以只能将这种不可描述的外在的，无形的力归结为神。所以最终他将这种力的研究归结于神学的研究上，最终在他的晚年，他投入大量时间去研究神学，结果可想而知神是不存在的，所以他的研究也是以失败而告终。
最终我们可以发现，牛顿虽然作为自然科学家近代著名的物理学家和自然科学的开创者，但是在他的一生当中并不是一个唯物主义，相反他是一个彻彻底底唯心主义，它所崇尚的是唯心主义和神学，在他晚年，他几乎用了近十年的时间投身了唯物主义的反驳和唯心主义研究，对神学进行一个充分的，合理的论述，当然，他所论述，这些在近代证明之后全都是错误的。
