第一、贡木和檀香的香味不同。贡木的香味是淡香型,产自巴布亚地区的贡木香味更淡,似有若无,前期是酱香类似黄花梨中的紫油梨,后期会转化出果香混合香,可以用手焐热或是放置在太阳下晒后,香味会稍微浓郁。而檀香的香味是清香中带了一丝甜,清新淡雅,比较持久。
第二、贡木和檀香的结香时间和方法不同,贡木结香是其树木倒架,即死后,经过几十年到几百年才会结香,因为其结香特性当地人又称其为永生木,檀香的结香方式为在其树木生长过程中,因被虫咬或受外界伤害而结香,在木材生长半年到二十年就会结香。因此目前市面上的沉香大多是在人为干预下而结香,但贡木不行。
第三、贡木和檀香的花纹不同。贡木的表面有着龙鳞、火焰、星空等花纹,非常漂亮,因为可以支撑手串盘玩,而檀香树皮灰暗,表面平滑,更多的是用来品香。