倭黑猩猩是高度智能化,社会化的动物。它们生活在稳定的地区,集群生活,能多达150名成员,虽然这通常在觅食和活动的时候会分裂成更小的群体,每群2~20余只,由1只成年雄性率领。食量很大,主要是水果,也吃树叶、根茎、花、种子和树皮,该物种比黑猩猩更多地依赖于植物的根茎。偶尔也吃昆虫、鸟蛋或捕捉小型脊椎动物,雄性获得的猎物允许群内成员共享。
倭黑猩猩几乎所有的时间都花在树上,在树上建造很简单的巢,在树枝上觅食水果,也能用略弯曲的下肢在地面行走。有一定的活动范围,面积26~78平方千米,觅食区域往往是它们集中的地点。群与群间有往来。长久保持母子关系,分群后还常回群探母。有午休习性。能辨别不同颜色和发出32种不同意义的叫声。能使用简单工具,是已知仅次于人类的最聪慧的动物。其行为和社会行为都更近似于人类,在人类学研究上具有重大意义。