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北京大学的教育学科历史悠久。早在1902年,京师大学堂即设立师范馆,开设教育学课程,培养教育专门人才。
1924年,北京大学设立教育学系,蒋梦麟、胡适等著名教育家先后担任教授会主席或系主任。
1949年,根据政府的统一规划,北京大学教育系科调整至兄弟院校。
20世纪80年代开始,教育学科在北京大学又逐步得到重建。
1984年发展为高等教育科学研究所,2000年,高等教育科学研究所、教育经济研究所与电化教育中心(前身为1973年建立的电教组)部分机构合并,成立北京大学教育学院。现任院长为阎凤桥教授,名誉院长为闵维方教授。