珠海有8个通关口岸，分别是拱北、九洲港、珠海港、万山、横琴、斗门、湾仔、珠澳跨境工业区等8个国家一类口岸。
1、拱北口岸
主要担负拱北口岸出入境人员、交通运输工具及其携带、载运的行李物品、货物等的边防检查任务，依法对口岸限定区域实施管理。拱北口岸开放时间为早6时至次日凌晨1时，通关时间为19小时，2014年以来连续5年客流量超过1亿人次，2018年达1.34亿人次，日均约36万人次。
2、九洲港口岸
中华人民共和国九洲出入境边防检查站地位于珠海市香洲区，地处珠江西面、伶仃洋北端、珠海市东南部，与香港相隔36海里，距澳门7公里。主要担负着九洲港口岸客运码头、香洲港码头、九洲直升机场等执勤点出入境船舶及员工、旅客、渔民的边防检查和监护任务。
3、横琴口岸
横琴口岸位于珠海市横琴岛东部，与澳门路环岛隔海相望，通过莲花大桥与澳门相连接，2000年3月28日经国务院批准正式对外开放。
2014年12月17日，为配合横琴新永久口岸建设，横琴过渡期口岸启用，并于12月18日零时起正式实施24小时通关。
4、港珠澳大桥口岸
港珠澳大桥珠海公路口岸限定区域由5部分组成，约203万平方米，口岸查验区由珠港、珠澳两个方向共10个查验场地构成，设计出入境旅客25万人次/日；出入境车辆4.3万辆次/日。远期预留通关量为出入境旅客45万人次/日、出入境车辆6.3万辆次/日。口岸设计建设通道量322条，其中珠港旅检方向132条；珠澳旅检方向108条；随车厅16条；车辆查验通道62。工作人员通道4条，工作车道、消防应急车道各2条。
5、斗门口岸
斗门口岸位于珠海市斗门区白蕉镇，处于西江出海口的磨刀门水道，水路距澳门17海里、香港54海里，陆路距斗门城区7公里、珠海市区50公里。
