保福寺的由来是因为寺庙叫保福寺。
保福寺建于明正德十一年(1516年),清时重修。后来据民国时调查,保福寺占地约二亩,有九间瓦房,土房两间,泥像九尊,另有石碑两座,井一眼,楸柳四棵。
保福寺所在的村子亦称保福寺,又名保福寺村。建国以后,中国科学院在此设所建宿舍,此地发生了巨大变化,成为中关村的核心。中国科学院工程热物理研究所、力学研究所、电工研究所、自然科学史研究所、过程工程研究所、声学研究所、数学与系统科学研究院、软件研究所、计算技术研究所、物理研究所、理论物理研究所、自动化研究所、国家空间科学中心、理化技术研究所等研究单位驻于该区域。