菌种保存的方法有斜面低温保藏法、液体石蜡覆盖保藏法、沙土保藏法、滤纸保藏法、甘油管保存法、冷冻干燥保存法。1、斜面低温保藏法：将菌种接种到适合的固体斜面培养基上，用油纸将棉塞部分包扎好，然后转移至2-8℃的冰箱中进行保存。2、液体石蜡覆盖保藏法：使用液体石蜡将斜面菌覆盖住，使其和空气隔绝。
一、菌种保存的方法有哪些
1、斜面低温保藏法
（1）将菌种接种到适合的固体斜面培养基上，等到菌种充分生长过后，使用油纸将棉塞部分包扎好，然后转移至2-8℃的冰箱中进行保存。
（2）如果是霉菌、放线菌及有芽孢的细菌，一般可以保存2-4个月左右，需要移种一次。如果是酵母菌，一般可以保存2个月左右，需要每个月移种一次。
2、液体石蜡覆盖保藏法
（1）将液体石蜡装在三角烧瓶中，并使用棉塞塞好，用牛皮纸进行包扎，然后在0.1MPa，121.3℃的环境下灭菌30分钟左右，接着将其放置在40℃的温箱之中，将水汽蒸发掉。
（2）将需要保藏的菌种，用适合的斜面培养基进行培养，得到健壮的孢子或者是菌体。
（3）使用灭菌过的吸管将液体石蜡吸出，注入斜面上，用量为高出斜面顶端1cm左右为宜。
（4）将试管直立，放置在低温或者是室温之下进行保存。
（5）霉菌、放线菌、芽孢细菌可以保藏2年以上不死，酵母菌可以保藏1-2年，一般无芽孢细菌可以保藏1年，脑膜炎球菌可以保藏3个月左右（37℃环境下）。
3、沙土保藏法
（1）准备好河沙，加入10%稀盐酸，然后加热煮沸30分钟左右，将里面的有机质去掉，然后将酸水倒掉，用自来冲洗至ph为中性，接着烘干，过筛（40目筛子），去掉粗颗粒。
（2）准备好非耕作层的不含腐植质的瘦黄土或红土，浸泡洗涤数次，直至ph为中性，然后烘干，碾碎，过筛（100目筛子），去掉粗颗粒。
（3）将沙和土按照2：1的比例混合，装入试管或者是安瓿管中，塞好棉塞，在1212℃的环境下灭菌30分钟左右。
（4）将菌种在斜面培养基中培养，得到健壮的菌体，然后向斜面培养物中注入3-5ml无菌水，洗下细胞或孢子制成菌悬液。
（5）使用灭菌过的吸管吸取菌悬液，然后均匀滴入沙土管中（0.2-0.5ml/管）。如果是放线菌或霉菌，可以直接挑取孢子拌入沙土管中。
（6）真空抽去沙土管中的水分。
（7）将沙土管用火焰熔封，然后存放在低温(4-6℃)干燥处保藏，或者是将沙土管用牛皮纸或塑料纸包好，放置在干燥器内保存。
