BOT是政府政府通过与投资人签订特许经营权协议吸引投资人对公共基础设施进行投资，项目的预期收益是投资人收回投资成本和获取投资回报的主要来源。运行特点是政府授权，投资人独立运作，运营期结束，项目产权无偿移交政府。PPP是政府和社会资本建立长期合作关系，由社会资本或双方共同建设、运营、管理公共设施并向社会公众提供服务的一种模式。运作特点是政府授权，以投资人为主，双方共同建设、运营和管理，根据双方投资比例，确定双方收益。联系：本质上差不多，都是政府吸引社会资本，推动公共基础设施建设，投资人通过项目融资，通过项目运营获取投资回报。区别：
1、PPP的范畴更广泛，涵盖的领域更多，除了基础设施建设、自然资源开发，还包括公共服务产品的民营化。而BOT主要集中于基础设施建设。
2、PPP更强调政府和社会资本的的参与 和合作，整合双方资源，强调资源配置，实现项目价值的最大化，共同收益，各担风险，而PPP是根据政府授权，独立承担项目的建设、管理和运营。
3、PPP更强调双方的风险分配，合理分担项目风险。而BOT则由投资承担主要风险。
4、融资方式和责任不同，债权人的追索程度不同：BOT的融资主体是投资人，投资人承担全部投资风险。PPP融资主体是项目公司，项目公司承担项目投融资风险，而社会资本方（母公司）并不承担全部融资风险。
5、项目周期不同，所有权不同。BOT有明确的运营期，投资人在运营期内拥有经营权。而PPP可能是整个项目周期，社会资本可能拥有项目的所有权。
6、阶段不同，在国民经济中和国家战略中的地位不同。BOT是PPP以展的第一阶段和试行阶段，在我国并未得到充分发展。而PPP是推进政府改革和职能转变的重要举措。PPP将使政府逐步退出投资，变身监管者、规则制定者和服务购买者，也是减轻政府负担、提高政府治理水平、清晰政府职能、改善和提高社会服务水平的重要方式。
