一、品种选择：由于果树的有机栽培过程中禁止使用任何人工合成的肥料、农药、除草剂、生长调节剂及基因工程技术等，因此，在栽培中不可避免的对品种选择和施肥技术提出了不同于常规果树栽培的要求。所以在品种的选择上应选择适应当地土壤气候特点，且对病虫害有抗性的品种，尤其应当考虑选择对该种果树可能造成重大危害的主要病虫害有抗性的品种，同时应充分考虑保护作物遗传多样性。
二、栽培措施
（1）清洁田园：许多危害果树的病菌孢子、菌丝体和害虫的卵、幼虫、蛹等，通常在果树的枯枝、落叶、病僵果和果园杂草中越冬，如炭疽病、黑斑病、黑星病、螨类、介壳虫类、卷叶蛾类等。因此，春季开园前和秋季采收后，必须彻底清理病枝残体、枯枝落叶，铲除杂草并带出田外销毁或深埋，以降低田间病虫的基数及侵染源。
（2）合理修剪：通过科学的修剪，疏除密丛枝条、摘除遮光果实的叶片、除去有病植株等措施，对树体进行整形控制，增强通风透光，以预防病虫害发生。
（3）科学管理：根据地下水位高低、降雨量、果园排水等因素，修筑不同的沟畦，以保持适当的土壤和空气湿度；
根据土壤肥力及果树生长需求科学施肥，保持植株健康的生长，创造有利于果树健康生长、遏制有害生物生长的环境。
三、肥料使用：有机果树栽培与常规果树栽培的根本不同在于病虫害的防治和肥料使用上的差异，在有机栽培中，对肥料的使用有严格的要求。
（1）肥料种类：有机认证机构认证的有机肥、微生物肥料；各类矿物质，包括钾矿粉、磷矿粉、氯化钙等；饼肥、草木灰等；利用畜禽粪、植物秸秆等自制的农家肥、植物沤制肥（必须充分腐熟，进行无害化处理）。
（2）施肥技术：一般应在秋季入冬前或早春时提前施用，施足底肥，将施肥总量60%-80%用作底肥，每亩施有机肥3000-4000公斤，结合耕地将肥料均匀地混入耕作层内，以利于根系吸收。
当果树营养不足时，可根据植株的缺素情况，选择经有机认证的肥料进行开穴追肥或叶面喷施。
