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磨子潭水库位于霍山县佛子岭水库上游东流河上，与佛子岭水库坝址相距25公里，控制流域面积570平方公里。水库大坝为混凝土大头坝，又称双支墩混凝土肋墩坝。坝高82米，坝长331米，由12个双支墩，东西两岸各3个单支墩及西岸转折段重力坝组成。
坝顶高程202．9米，防浪墙顶高程204米，总库容3．37亿立方米。溢洪道在大坝的西侧，底高程196米，6孔每孔净宽10米，设弧形闸门控制。大坝西端设有钢筋混凝土衬砌的泄洪洞1条，内径5．7米，进口底高程132．7米。东岸坝后式发电厂房，装机1．6万千瓦，年发电量0．58亿千瓦时。为提高佛子岭水库防洪标准和充分开发水利资源，确定兴建磨子潭水库。1956年9月，开挖隧洞明渠。大坝清基、工场布置及砂石开采亦相继开工。同年12月，水利部批准大坝开始浇筑混凝土。1958年6月9日，大坝混凝土全部浇筑到顶。1959年12月水电站并网发电，1960年1月电站全部建成。水库全部工程于1968年完成。
磨子潭水库的建成，提高了佛子岭水库的防洪标准，调节径流与佛子岭、响洪甸水库共同灌溉淠河灌区，发挥了综合利用效益。1969年7月发生特大暴雨，洪水漫坝。1970年汛前，加固了坝后基岩被冲刷的部位。1975年8月河南暴雨后，配合佛子岭水库进行加固加高、扩大泄洪能力的同时，确定磨子潭水库今后需适当加高大坝和扩大泄洪设施。
