深圳限行同一天被拍两次算一次吗

是算一次的，深圳限行规则规定如果外地牌车在限行时间段被拍一次，那么同一天不管在任何地点被拍都算一次闯限行，所以如果实在被拍了，那么你当天就不用担心会多次被拍了，但尽量避开早晚高峰期，被拍也是会罚款扣分的，也可以提前一天去申请通行证的。