齐齐哈尔这个名字的由来有多种说法。
一种说法是源于契丹语,济沁哨卡之名“齐齐”是济沁的谐音,由济沁河得名,“哈尔”是“哈日”,在古契丹语中有阻挡、防守之意,在军事上作为哨卡、哨所解释。
另一种说法是起源于蒙古族系原住朵儿边部落的一个游牧点,这个游牧点的蒙古语音译名字是“齐婀勒齐戈尔塔拉”,汉语意思是“肥软的草原”。
还有一种说法是齐齐哈尔是込斡尔语,由“齐齐仁”“哈日”两个词根组成,汉意“陡岗牧场”,转意为“天然牧场”。
最终,康熙十三年(1674)为抵制沙俄入侵,清政府自吉林乌拉调水师编为齐齐哈尔水师营驻此,并设总管,将齐齐哈尔村改建为城市,康熙皇帝御赐城名:齐齐哈尔。