1、红色花系，是牡丹园的大家族，品种多达200余个，其中还有深浅之分。如“一品朱衣”，猩红欲流，芳冠百花；“春红娇艳”，朝霞藏日，光彩陆离；“红绣球”，深浅相间，胭脂染成。
2、黄色花系，如“姚黄”、“金玉交章”，端庄典雅，姿貌绝伦。
3、白色花系如“冰壶献玉”、“昆山夜光”、“玉板白”等素洁无暇，清爽袭人
4、蓝色花系虽不如红色品种多。但却也姐妹成群。“蓝宝石”、“蓝花魁”、“紫蓝葵”、“吊枝蓝”、“冷光蓝”、“蓝田玉”，都是牡丹之中的上品，这“蓝田玉”就是清代曹州花农赵玉田精心培育而成的。此花支形增开张，花蕾圆大，花开时呈浅粉蓝色，花朵直上，蓝光闪闪，非常惹人喜爱。
5、粉色花系也是牡丹园里一大分支。“粉彩球”、“粉容面”、“粉翠球”、“赛斗珠”、“翠娥娇”、“青龙卧粉池”，这些都是牡丹花中名品。再如“赵粉”，稍弯曲的枝杆，粗壮的花梗，黄绿色的叶面，圆尖型的花蕾，侧开、大型的花朵，细腻整齐的花瓣，发出阵出清香，分外诱人。
6、紫色花系在菏泽牡丹品种繁多，除魏紫外，还有“葛巾紫”、“紫金盘”、“紫霞点金”、“邦宁紫”等。“邦宁紫”，就是明代曹州花农赵邦宁多年心血的结晶。
7、绿色、黑色和复色花系，如“兰绿”“冠世墨玉”“二乔”等，更是色奇出众，别有千秋。
