食用菌主要用熟石灰，一般先买生石灰，加少量水反应生成熟石灰。料中加入的石灰宜用新生的熟石灰，不用建筑用熟石灰，是因为石灰中含杂质较多。
石灰具有显著消毒杀菌作用，含有丰富的钙元素，在食用菌生产中有广泛的用途。
一、石灰的用途
1、用在场地消毒上
包括菌种培养室、出菇场地、四周环境。首先清除场地四周杂草，撒一层石灰粉，然后将培养室打扫干净，喷常规杀虫药物，再撒一层石灰粉。但一定要浇一下水，即白灰湿润后才能发挥消毒作用。这样能杀灭部分杂菌，减少污染基数，对防止细菌性污染作用很大，同时又防止蛞蝓等部分害虫侵入场地。
2、用在培养料中
石灰是培养基pH值的决定因素，为食用菌提供钙素，控制杂菌的杀菌剂，当PH值大于7时不利杂菌繁殖，并能把料中不易被吸收的营养转化为可被吸收的营养。这是合理的石灰量产生增产效果的理论基础。白灰中的钙元素能使菌丝粗壮，提高产量。在多数食用菌生产、菌种培养基配方中都有石灰。
石灰是溶解蛋白质的消毒剂，不分杂菌种类，一律都是杀灭对象，石灰的浓度越大，灭菌效果越好。精料是杂菌滋生的主要场所，因此要重点做好精料的杀菌。一般做法是，先用较少的水与石灰混合成石灰乳，拌入精料。闷一定时间，再拌入全部料并添足水分。然后再用发酵、锅蒸方法使石灰发生化学变化，料的pH值随之下降，使之适于食用菌生产发育。
大部分食用菌都能在微碱性的培养料中正常生长，除猴头等喜酸性菌外。在培养料中加入1%~2%的石灰，可基本控制生料栽培中的杂菌污染。实践证明，生料栽培平菇，加入2%的石灰与不加石灰对比，前者杂菌污染率在2%以下，后者高达20%~30%。因为未加石灰的料经堆制发酵后酸性偏大，PH值一般在5~6以下，适宜各类杂菌的孽生，易引起杂菌暴发性污染。而加入石灰的培养料呈碱性，发酵后可保持PH8左右，杂菌较难生长，从而达到控制杂菌的目的。另外，由于石灰含有大量的钙元素，使用后菌丝粗壮洁白，同时还可增强菌块的结实性，提高产量。
3、用在防鼠灭虫中
由于菌丝有特殊的香味，老鼠非常喜欢咬食，特别是用粮食粒做菌种老鼠特别爱咬，如果在药物防鼠的基础上配合使用石灰，具有事半功倍的效果。在发菌室出入口，铺一行石灰粉，老鼠会因吸入石灰而止步。
二、石灰的质量
食用菌用的白灰要求：要有碱性PH值在12以上，最简单的鉴别办法是，用水稀释一点白灰，然后把玉米芯放到白灰水中，玉米芯变黄绿色即可购买。
一般先买生石灰，加少量水反应生成熟石灰。料中加入的石灰宜用新生的熟石灰，不用建筑用熟石灰，是因为石灰中含杂质较多。
石灰不纯增加用量，最方便的做法是知道拌料后应有的pH值。先在拌料后实测pH值，实测值低于应有值时，可在料中逐步增加石灰乳，等实测值与应有值一致时停止。若是查不到这个数据，可查食用菌对pH值的适应范围。在发酵后（生料栽培）或锅蒸后（熟料栽培）实测pH值，这个值若低于最适pH值的上限，下次拌料时增加一定数量的石灰，发酵后或锅蒸后再测，逐步确定合理用量。以最适pH值的上限为准，是因为食用菌生长过程可使生产料的pH值下降。
