孔令辉2006年正式宣布退役，任中国女子乒乓球队教练。2013年正式担任中国女子乒乓球队主教练 。2017年5月30日，中国乒乓球协会决定暂停孔令辉中国女乒主教练工作，立即回国接受进一步调查和处理。
1975年，孔令辉在哈尔滨出生。父亲孔祥智是黑龙江省队的乒乓球运动员、母亲谷淑霞是一位教师。在父亲的影响下，6岁开始正式学习打球，为了从小培养他敢拼强手的心理状态，孔祥智还打破少年队员训练的常规，让他和大孩子一起训练、打比赛，然后总结得失。
孔令辉在2017年因为争议事件离职、一直赋闲至今。
1975年出生的孔令辉是中国乒乓球队历史上的一位标志性人物：他在年仅19岁的时候便夺得了世乒赛的男单冠军，创造了国乒的一个低龄纪录；同时又是中国男队第一个拿到这枚金牌的横拍打法运动员，开启了一个全新的时代。
2000年，孔令辉在乒坛“世纪大战”——悉尼奥运会上战胜瓦尔德内尔，拿到了小球时代的最后一个世界冠军，同时也成为了男子乒坛的第3位大满贯得主，他亲吻国旗的场景也成为了中国球迷心中的经典回忆。
2006年，孔令辉正式退役并转型成为女队教练，次年便指挥小将郭跃（当时才19岁）夺得世乒赛女单冠军，这也成为了他执教生涯的一个高峰，但不久后郭跃便高开低走、逐渐失去新生代领军人物的地位，而孔令辉也因此而受到了一定的质疑。
2012年，孔令辉接替施之皓出任国乒女队主教练职务，此后执掌帅印长达5年时间。
