神农架交通以公路为主,二零九国道、白(白果树)红(红花朵)省道、酒(酒壶坪)九(九湖)区道彼此联系。境内公路全长1300多公里、贯穿全区南北东西。并与襄阳、十堰、宜昌、兴山、巴东等市县公路联成网络。从武汉去神农架可以在新华路长途汽车站乘长途车,也可以从武汉坐火车先到十堰,然后到汽车站去神农架。目前去神农架木鱼镇的最佳路径是坐火车先到宜昌,然后从宜昌坐汽车转到木鱼镇。去神农架松柏镇、红坪镇先坐火车到十堰市,再坐汽车走武神公路(旅游公路)最为方便。
航空方面,神农架机场已于2014年4月28日通航,首飞为东航的上海—武汉—神农架航线,2015年5月5日开通重庆—神农架—武汉航班。