依据生物活性物质分子本身的理化特性,如溶解度、带电性、大小、挥发性等进行分离纯化，植物的活性物质的提取多采用：溶剂法、水蒸汽蒸馏法、超临界二氧化碳提取分离法、萃取法。分离多用硅胶柱色谱法。
植物的活性物质的提取多采用：溶剂法、水蒸汽蒸馏法、超临界二氧化碳提取分离法、萃取法.分离多用硅胶柱色谱法.动物的生理活性物质提取分离比较复杂,方法多种：如盐析法、电泳法、高速离心法、受体识别法等.
动物的生理活性物质提取分离比较复杂，方法多种：如盐析法、电泳法、高速离心法、受体识别法等。
、超声波提取法
超声波提取法顾名思义，就是说利用超声波来达到提取的目的；这种方法能够产生强烈的振动和产生空化效应，加速植物里的物质扩散并溶解。用超声波提取主要是物理过程，其特点为：在做溶剂提取时，能够最大化的缩短提取时间，浸出率高，效率比较高，无需加热，能够有效的节约能源。
二、酶提取法
酶提取法主要是利用植物当中的纤维素、蛋白酶等，破坏植物的细胞，从而达到提取的目的；在使用这种方法的时候很多因素都会影响到植物提取率，如：ph的值、酶解温度、时间。目前，还在研究酶提取法的工艺条件。
三、微波辅助提取法
微波辅助提取法是一种较新的技术，主要是利用微波来加速提取率的；微波加热能够有效的提取和分离植物，并且能够微调温度参数，灵活运用；其原理为：用温度破坏植物内部，使得植物内部能直接与相对冷却的提取溶剂接触，这样就强化了提取过程。其优点为：比传统的提取方式速率快、减少时间的同时，也能避免有价值的提取物流失。
四、溶剂提取法
溶剂提取法就是利用溶剂从植物中提取有效成分，其溶剂必须具备和植物能够相融的特点；使用这种方法提取的时候，影响提取率的有：溶剂的浓度、提取温度等；通过实验证明，使用溶剂提取法能够节约提取的时间。
五、超临界流体萃取法
超临界流体萃取法和微波辅助提取法一样，同为较为创新的技术，此方法一般采用co2作为提取溶剂；这种方法是利用其溶解能力和物质的温度，进行升温降温，达到分离纯化；其优点如上面提到的：绿色环保，活性成分保存的好。
