黄芪播后2~7年均可收获,在9~11月或早春萌芽前都可采挖,在气温较高,土质较差的地方,一般播后2年收获,若年限太长,根容易产生黑心或木质化严重。但在冷凉肥沃的山区腐殖质土上种6~7年的根仍然充实,而不木质化,挖时宜深刨,以防挖断根,或用机械把深层土抖松后把根拔出。
近几年来许多地方都提前收获,如蒙古黄芪在一些地方多采用育苗移栽,即育苗1年再移栽培育1年就挖收。膜荚黄芪在河北安国一带只种1年就收,质量较差。
根挖出后切下芦头,抖净泥土,晒至半干,再集中堆1~2天“发汗”再晒,直到晒干为止,剪去侧根及须根,扎成小捆,即成生黄芪。以身条干、粗长、质坚而绵、味甜、粉性足者为佳。如根形不好、短粗、叉根多的,可切片晒干。667米2产干货200~300千克,高产者可达400~500千克。