1、定义的不同
流通加工方式，是为了提高物流速度和物品的利用率，在物品进入流通领域后，按客户的要求进行的加工活动方式，而生产加工方式，是委托生产加工从事创造社会财富的活动和过程。
包括物质财富、精神财富的创造和人自身的生育，亦称社会生产，通过一定工序和方式将原材料、半成品转化为目标需求的过程的活动方式。
2、加工的对象不同
流通加工的对象是进入流通领域的商品，生产加工的对象不是最终商品而是原材料、零配件、半成品。
3、组织加工者的不同
流通加工的组织者是从事流通工作的商业企业或物流企业；而生产加工的组织者则是生产企业。
4、加工程度的不同
流通加工大都为简单加工，是生产加工的一种辅助和补充；而生产加工则较为复杂。
5、加工的目的不同
生产加工的目的是创造价值和使用价值；流通加工的目的是完善商品的使用价值并在对原商品不作大的改动情况下提高其价值。
流通加工和一般的生产型加工在加工方法、加工组织、生产管理方面并无显著区别，但在加工对象、加工程度方面差别较大，其差别主要为：
1、流通加工的对象是进入流通过程的商品，具有商品的属性，以此来区别多环节生产加工中的一环。生产加工对象不是最终产品，而是零配件、半成品。使物品发生物理、化学或形状的变化。
2、 流通加工过程大多是简单加工，而不是复杂加工，一般来讲，如果必须进行复杂加工才能形成人们所需的产品，那么，就需要设生产加工来完成，生产过程理应完成大部分加工活动，流通加工对生产加工是一种辅助及补充。流通加工绝不是对生产加工的取消或代替。
3、从价值观点看，生产加工目的在于创造价值及使用价值，而流通加工则在于完善其使用价值，并在不作大改变情况下提高价值。
4、流通加工的组织者是从事流通工作的人员，能密切结合流通的需要进行加工活动，从加工单位来看，流通加工由商业或物资流通企业完成，而生产加工则由生产企业完成。
