(一)流通加工地点设置的不合理
流通加工地点设置即布局状况是使整个流通加工能否有效的重要因素。一般而言，为衔接单品种大批量生产与多样化需求的流通加工，加工地设置在需求地区，才能实现大批量的干线运输与多品种末端配送的物流优势。
假如将流通加工地设置在生产地区，其不合理之处在于：第一，多样化需求要求的产品多品种、小批量由生产地向需求地的长距离运输会出现不合理；第二，在生产地增加了一个加工环节，同时增加了近距离运输、装卸、储存等一系列物流活动。所以，在这种情况下，不如由原生产单位完成这种加工而无须设置专门的流通加工环节。
一般而言，为方便物流的流通加工环节应设在产出地，设置在进入社会物流之前。假如将其设置在物流之后，即设置在消费地，则不但不能解决物流问题，又在流通中增加了一个中转环节，因而也是不合理的。
即使产地或需求地设置流通加工的选择是正确的，还有流通加工在小地域范围的正确选址问题，假如处理不善，仍然会出现不合理。这种不合理主要表现在交通不便，流通加工与生产企业或用户之间距离较远，流通加工点的投资过高(如受选址的地价影响)，加工点四周的社会、环境条件不良等。
(二)流通加工方式选择不当
流通加工方式包括流通加工对象、流通加工工艺、流通加工技术、流通加工程度等。流通加工方式的确定实际上是与生产加工的合理分工。分工不合理，本来应由生产加工加工完成的，却错误地由流通加工完成，本来应由流通加工完成的，却错误地由生产加工完成，都会造成不合理。
流通加工不是对生产加工的代替，而是一种补充和完善。所以，一般而言，假如工艺复杂、技术装备要求较高，或加工可以由生产过程延续或轻易解决者都不宜再设置流通加工，尤其不宜与生产过程争夺技术要求较高、效益较高的最终生产环节，更不宜利用一个时期市场的压迫力使生产者变成初级加工或前期加工，而流通企业完成装配或最终形成产品的加工。假如流通加工方式选择不当，就会出现与生产夺利的恶果。
(三)流通加工作用不大，形成多余环节
有的流通加工过于简单，或对生产及消费者作用都不大，甚至有时流通加工的盲目性，同样未能解决品种、规格、质量、包装等问题，反而增加了环节，这也是流通加工不合理的重要形式。
(四)流通加工成本过高，效益不好
流通加工之所以能够有生命力，重要优势之一是有较大的产出投入比，因而有效起着补充完善的作用。假如流通加工成本过高，则不能实现以较低投入实现更高使用价值的目的，除了一些必需的、服从政策要求即使亏损也应进行的加工外，都应看成是不合理的。
流通加工合理化指实现流通加工的最优配置，不仅做到避免各种不合理流通加工，使流通加工有存在的价值，而且综合考虑流通加工与配送、运输、商流等的有机结合，做到最优的选择，以达到最佳的流通加工效益。
不合理的流通加工形成的情况有：
①加工与配送相结合；
②加工与配套相结合；
③加工与合理运输相结合；
④加工与合理商流相结合；
⑤加工与节约相结合。
