1、内容不同，签证是指在施工过程中实际发生的图纸以外的东西，或者说是原本预算中未考虑的内容，可能产生工程费用和有必要作为现场记录而形成的文字性的东西。变更是指对合同中的工作内容作出了修改追加或者取消了某一项工作；
2、法律效力不同，施工签证是工程承发包双方互相书面确认的签证即成为工程结算或最终结算增减工程造价的凭据，项目管理中的变更指项目干系人常常由于各种原因要求对项目计划进行修改，甚至重新规划，这一类修改或变化叫做变更；
3、主体不同，工程签证是是承发包人双方协商一致的结果，是双方法律行为，变更是指指承包人根据合同对工程项目作出的调整和修改。
【法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第二条 建设工程施工合同无效，但建设工程经竣工验收合格，承包人请求参照合同约定支付工程价款的，应予支持。第三条 建设工程施工合同无效，且建设工程经竣工验收不合格的，按照以下情形分别处理：
（一）修复后的建设工程经竣工验收合格，发包人请求承包人承担修复费用的，应予支持；
（二）修复后的建设工程经竣工验收不合格，承包人请求支付工程价款的，不予支持。因建设工程不合格造成的损失，发包人有过错的，也应承担相应的民事责任。第五条 承包人超越资质等级许可的业务范围签订建设工程施工合同，在建设工程竣工前取得相应资质等级，当事人请求按照无效合同处理的，不予支持。第七条 具有劳务作业法定资质的承包人与总承包人、分包人签订的劳务分包合同，当事人以转包建设工程违反法律规定为由请求确认无效的，不予支持。
