G+菌有磷壁酸，而G-菌有外膜和脂多糖。它们共同细胞壁的共有组分是肽聚糖
G+（革兰氏阳性菌）细胞壁是由肽聚糖和磷壁酸组成，肽聚糖又称为粘肽，是原核生物细胞所特有，但不同种类其含量有显著差异。肽聚糖的结构由聚糖骨架、四肽侧链和五肽交联桥三部分组成（革兰氏阴性菌缺乏五肽交联桥）。肽聚糖层数多，约15~50层；含量高，占细胞壁干重的50%~80%；且为质地致密、坚韧的三维空间结构。磷壁酸是革兰氏阳性菌细胞壁的特有成分，占细胞壁干重的50%以上，依据结合部位的不同，分壁磷壁酸与膜磷壁酸两种，前者与肽聚糖的N-乙酰胞壁酸相连，后者与细胞膜中的磷脂相连，二者均伸到肽聚糖的表面，构成革兰氏阳性菌重要的表面抗原。
革兰氏阴性菌（G-）细胞壁肽聚糖有1~3层，含量少，占细胞壁干重的10%左右；且为结构疏松的二维平面结构，由内向外依次为脂蛋白、外膜、脂多糖。脂多糖由类脂A、核心多糖和特异性多糖组成，为细菌的内毒素，与细菌的致病性有关，也是革兰氏阴性菌的菌体抗原，决定了细菌的抗原性；外膜类似细胞膜的结构，为脂质双层，其内镶嵌着多种特异性蛋白，与细菌的物质交换有关；脂蛋白位于外膜与肽聚糖之间，由蛋白和脂质组成，脂质连接于外膜脂质双层的磷脂上，蛋白连接在肽聚糖的侧链上，使外膜和肽聚糖构成一个稳定的整体。
